定期进行消毒对防治鸭病具有积极作用。应该选用有机氯等高效低毒的消毒药，目前用于肉鸭养殖场环境消毒的药物有：醛类（甲醛、戊二醛）、碱类（如烧碱、生石灰）、卤素类(氯制剂有漂白粉、消毒王、灭毒威等)、过氧化物类（如过氧乙酸）、季胺盐类（如百毒杀）。制定消毒程序，一般10－15天进行一次带鸭消毒，5－7天一次环境消毒。同时，疫苗预防必不可少，要加强疫苗的防疫，结合当地疫病制定合理的免疫程序，虽然肉鸭生长周期短，但是药物预防不能代替疫苗预防。