肉鸡后期死亡造成重大经济损失，为防治此种情况的发生，首先加强饲养管理，做好日常的管理工作。

饲养管理最好采取网上饲养方法。对于在地面平养时应采取加厚垫料的高度，勤换垫料，定期做好杀虫、灭鼠的工作，禁止飞鸟、野禽进入鸡舍。全场实施全进全出的制度，加强中后期的痛风换气，定期带鸡消毒，最佳带鸡消毒药可选用二氧化氯和戊二醛，因其对病毒、细菌、支原体都有很强的效果，并且对呼吸道粘膜刺激性较小。

对于发生球虫病时：一是加强管理，注意痛风换气，并且及时的清理粪便，保持鸡舍的干燥和清洁卫生；二是发病后及时用药可以使用磺胺类药物治疗，但要注意使用剂量和使用周期，并且在饮水中添加肾肿解毒药。在治疗球虫的过程中最好能够几种药物交替使用，以防止产生耐药性和影响治疗的效果；三是在治疗的过程中多维素要增至3~5倍，全天使用氨基金维他饮水，如果发生严重的肠道出血，在每千克饲料中添加维生素K33~5毫克，以缓解症状，防止贫血和愈后不良，影响生长速度和饲料的转化率。

制定科学的免疫程序每个养殖场的免疫程序的制定与地区疾病流行特点、疫苗种类、免疫方法、母源抗体水平，鸡的品种和气候特点等有关。建议养殖户不要乱用疫苗，最好根据抗体检测决定相应疾病疫苗的免疫时间。

为防治肉鸡腹水综合征的发生，除了在饲料方面采取相应的限饲，降能，改变环境外，在饲料中适当添加抗氧化剂如维生素A、维生素E、维生素C和中药龙胆泻肝散等均有一定疗效。
发生脂肪肝时以消脂为主，防病为辅。在每千克饲料中加入2.6克氯化胆碱拌料5天。调整饲料配比，确保有3%~4%的麸皮，降低玉米等碳水化合物饲料比例，在冬季可适当以富含亚油酸的油脂类物质替代2%~3%的玉米，可增加对不饱和脂肪酸的利用，减少脂肪沉积。同时用降脂增蛋类中草药拌料5天，防止因鸡体质下降而引起杂菌感染。