1、根据病理变化进行区别

　　鸡发生盲肠球虫时，两侧盲肠呈暗红色，内有鲜红色血样内容物;小肠球虫病鸡的空肠、回肠上有高梁粒大的出血点和米粒大的白色结节，内有番茄酱样内容物。坏死性肠炎，小肠严重肿大，内有气体，外观呈紫红色，肠粘膜坏死、脱落，肠腔内有红色粥样内容物;盲肠肝炎的特征病变是肝表面有边缘隆起的玉米粒大小的溃疡灶，有时溃疡灶融合成片;盲肠内有硬的栓塞物，多局限于一侧盲肠。

　　2、通过实验室检验鉴别诊断

　　将肠内容物涂片、镜检，如果能见到大量球虫卵囊，证明是球虫病;涂片用革兰氏染色、镜检，若有大量粗大的革兰氏阳性杆菌，说明是坏死性肠炎;将病料制成悬滴标本、镜检，发现活动的虫体，说明该鸡患有盲肠肝炎。

　　3、根据症状进行区别

　　鸡发生球虫病时，粪便呈鲜红色或番茄酱样，鸡冠苍白;发生坏死性肠炎的病鸡排暗红色稀便，常有气泡;而盲肠肝炎的病鸡，排蛋清蛋黄样粪便，周边带血，鸡冠呈紫色。