淡水小龙虾对环境的适应力及耐低氧能力很强,甚至可以直接利用空气中的氧,但长时间处于低氧、水质过肥或恶化的环境中会影响淡水小龙虾的蜕壳速率,从而影响生长。因此,水质是限制淡水小龙虾生长,影响养虾产量的重要因素。不良的水质还可助长寄生虫、细菌等有害生物大量繁殖,导致疾病发生和蔓延,水质严重不良时,还会造成小龙虾死亡。在池塘高密度养殖淡水小龙虾时, 池水透明度要控制在40 厘米左右,按照季节变化及水温、水质状况及时进行调整,适时加水、换水、施肥,营造一个良好的水体环境。淡水小龙虾养殖水质管理掌握以下原则: 
     
　　“春浅、夏满”原则。春季水位一般保持在0.6～1  米之间,浅水有利于水草生长、螺蛳繁育和幼虾蜕壳生长。夏季水温较高时,水深控制在1～1.5 米,有利于小龙虾度过高温季节。 
     
　　“先肥、后瘦”原则。保持养殖水体“肥、活、嫩、爽”,早期虾苗幼小,肥水能培育浮游生物,有利于提高幼虾培育成活率;中后期水质清瘦能促进小龙虾快速生长,提高产量。一般早期池水透明度在30 厘米左右,后期透明度保持40 厘米以上。 
     
　　改善养殖水质。每半个月泼洒1 次生石灰水,每亩水面1 米水深用生石灰10 公斤,使池水pH值保持在7.5～8.5  之间可以增加水体钙离子浓度,促进淡水小龙虾蜕壳生长。定期施微生物制剂, 改善养殖池塘的水质和底质。