引起仔猪腹泻的寄生虫有猪球虫，隐孢子虫、蛔虫、类圆线虫、猪小袋纤毛虫、鞭虫和棘头虫等。这些寄生虫病常与细菌病和病毒病混合感染，使病情复杂化，增大临床诊断的难度，也加大了病死率。猪球虫病主要危害1～3周龄的仔猪，临床上表现为腹泻，为水样便和糊状便，呈白色或黄色。猪鞭虫病，常引发2～6月龄的猪血痢，贫血、消瘦、生长缓慢，并可与猪痢疾并发。

猪蛔虫病，各种年龄的猪均可感染，但主要危害3～6月龄的猪，临床上表现为咳嗽，体温升高，食欲不振，异嗜，贫血，消瘦，磨牙，被毛粗乱，生长缓。慢，形成僵猪，有时也可造成死亡。猪类圆线虫病，主要危害1～3月龄的猪，可经胎盘感染，临床上表现为病猪贫血、消瘦、腹痛、下痢、粪便带血或黏膜，最后可因衰竭而死亡。