又称蓝绿藻，地球上最早出现的生物之一。常见的种类有色球藻、念珠藻、地木耳、发藻等。蓝藻无真正的细胞核，属于原核生物，其遗传物质是一个环形双链DNA，没有组蛋白与之相结合。细胞质内有大量核糖体，但无叶绿体、线粒体、高尔基体和内质网等细胞器。蓝藻细胞内含叶绿素a，能进行光合作用并放出氧气，放氧是蓝藻与光合细菌的主要不同之处。蓝藻还含有胡萝卜素、叶黄素、大量的藻蓝素及藻红素等，所以多数蓝藻呈蓝绿色，有的呈红色或黄褐色。蓝藻都不具鞭毛，藻体有单细胞的、群体的和丝状体的。蓝藻都没有有性生殖，单细胞体和群体的蓝藻，主要以细胞分裂方式进行营养生殖；丝状体除细胞分裂外，还靠藻殖段断离，丝体条数增多；极少数种类可以产生孢子，进行无性生殖。蓝藻生命力极强，可生活在淡水、海水、潮湿的岩石、土壤；甚至树干上；而且在极热、极冷或非常干燥的气候环境中均能生存。有些蓝藻是名贵食品（如发菜），有的蓝藻死后沉积海底形成藻礁，可以作为建筑材料，固氮蓝藻能提高土壤肥力。蓝藻有时也造成危害，如形成“赤潮”，使水质发臭，蓝藻死亡分解后产生的毒素直接危害水产养殖业。