一、灵活掌握用量：使用硫酸铜少了无效，多了有害，与水环境中鱼类密度、水质、pH值、水温、水深度等有密切关系，使用时要在准确测量养殖用水的体积，正确计算用药量的基础上。视具体情况而灵活掌握。
二、不能经常使用：硫酸铜过量会引起鱼类肾组织坏死、造血组织破坏、肝脂肪增加，同时还可能残留在鱼类的鳃、肌肉和肝内，妨碍肠道的吸收，从而影响鱼类的摄食和生长，部分鱼类出现烂鳃症状，故不能经常使用。
三、用后防止缺氧：用硫酸铜杀灭藻类的水体，要防止藻类和原生动物死后分解消耗大量氧，使池水缺氧，所以用药后，要加强观察，若发现缺氧应立即加注新水、用增氧机增氧或使用增氧剂增氧。杀灭藻类宜采用下风头局部用药的方法。
四、使用合剂效果更好：硫酸铜经常与硫酸亚铁按5∶2的比例混合使用。硫酸亚铁为辅助用药，有收敛作用，主要为硫酸铜杀灭寄生虫扫除障碍硫酸亚铁主要是消除固着物，为硫酸铜杀灭寄生虫扫除障碍。
五、小瓜虫病和卵甲藻病禁用：因为硫酸铜不能杀灭小瓜虫，反而会刺激小瓜虫大量繁殖，加重病情。发生卵甲藻病的池塘不能用硫酸铜治疗，因为该池塘的水呈酸性，用药后，会很快增加池水的酸性，使鱼难以忍耐而致死。
六、硫酸铜造成的药害可用生石灰化解：硫酸铜可用生石灰中和化解，每亩生石灰用量不超过30千克。
其实，现在用硫酸铜既不经济也不实用。随着科技进步和社会经济发展，商品渔药已完全满足鱼病防治的需求，建议养殖者对症选用商品渔药，这样会收到的满意的防治效果。