1.水质要清新
鱼苗孵化的用水要求水质清新，无毒无污染，溶氧充足，酸碱度适中，无敌害生物。
2.水温要适度
一般鱼苗的孵化温度要求在20～30℃之间，这段时间较易受到寒潮袭击，天气时冷时热，易使鱼卵冻死或染上水霉病，造成鱼苗孵化失败。所以这段时间要特别强调做好防寒保暖工作，准备好加温设备。
3.清除敌害生物
清除水中的敌害生物可以通过过滤设备或者药物方法加以清除，孵化用水一般要经过70～80目的尼龙筛绢或者相当于这种规格的其它网过滤。由于过滤时间长，敌害生物和杂质的积累，会直接影响过滤效果，所以要定期清除杂物和更换过滤网。最好是配置一个蓄水池，让过滤水流入蓄水池保存，这样便于使用药物，杀死孵化用水中的剑水蚤、水蚤等敌害生物。杀灭水中水蚤等有害生物，每立方米水体可用2.5％敌百虫粉剂1克泼洒孵化用水，或每立方米水体用90％晶体敌百虫0.1克全池泼洒。在使用敌百虫杀灭水体中的有害生物时，某些鱼类对敌百虫较为敏感，如淡水白鲳，这时可采用高锰酸钾泼洒孵化用水，用量为每立方米水体用高锰酸钾5克，溶解后泼洒孵化用水，可以清除水体中的水蚤。
4.孵化用具的消毒
孵化鱼苗的用具如网片、桶、盆等要用高锰酸钾或二氧化氯消毒后才能使用。