随着深秋初冬的来临，气温变化大。鱼类的肠炎、赤皮、腐皮病、疖疮病、小瓜虫、指环虫等和鳖的白底板病等病害将扩大其危害，要做好预防工作。同时，还应防范环境变化所引起的疾病。
下一阶段，一些疾病会随着温度的变化而受到抑制，但随着养殖个体的不断增加，水体负载逐渐增加，因此防止水质恶化非常重要。其主要防范措施如下1、加强水质监测，提高水体质量。由于现在已是养殖中后期，养殖水体的有害生物相对累积较多，因此有条件的地方要加大换水量，提高水位，必要时可适当投放水质改良剂。改善养殖水环境，也可通过消毒降低水体中病害生物的活力，从而阻断其传播途径。
2、坚持“以防为主、防治结合”原则，实行科学投喂，增强养殖种类的体质，采用国家规定的鱼用药物对症下药，对即将出池上市的养殖种类，应注意所用药物的休药期，确保水产品质量安全。