据了解，此次海南水灾以文昌、琼海和万宁最为严重。10月8日，海南昌盛鱼鳖种苗场总经理周旭告诉本刊，文昌地区被淹的鱼塘和虾塘估计有30%-40%左右，琼海被淹掉的鱼塘和虾塘估计有50%-60%。周旭有做罗非鱼料经销，在水灾过后就一直在外查看客户的受损情况，'我估计用自己饲料的罗非鱼养殖户损失在300-400万左右，很多鱼塘的塘基都被冲垮了。'
对于海南的罗非鱼养殖户而言，此次水灾无疑又是一次沉重的打击。在2009年，海南暴发了严重的罗非鱼链球菌病，养殖户损失惨重，而且当年的罗非鱼塘头价一度跌至成本线以下，很多养殖户都是亏本养殖，'好不容易今年的罗非鱼价格还可以，本以为有点钱赚，想不到一场水灾又什么都没有了。'10月9日，当本刊致电海南文昌的一位罗非鱼养殖户时，他告诉本刊，水位最高时漫过自己的塘基足足有4米，'现在正是罗非鱼的上市期，塘里都是准备卖的大鱼，一下子跑了一大半，大半年的辛苦都白费了。'
苗场基础设施受损 秋苗生产暂时停止
不光是罗非鱼养殖户，此次水灾也给海南苗场的秋苗生产带来了极大的麻烦。在水灾过后，本刊在向海南各大罗非鱼苗场了解情况时得知，很多苗场的基础设施受损，电路系统被淹，罗非鱼种苗生产只得暂停。
据了解，在今年6月份过后，海南便出现持续的高温天气，受天气炎热等诸多因素影响，今年海南各大苗场秋苗产量普遍大幅下滑，有业内人士估计，今年海南地区罗非鱼秋苗产量可能只有去年的30%左右。秋苗短缺，鱼苗的价格也随之水涨船高，据本刊了解，有苗场将鱼苗的价格增加了20%-30%左右。
在水灾过后，不少苗场向本刊表示，持续的暴雨使得海南气温下降，对秋苗的生产反而更为有利，但由于苗场基础设施的恢复需要一段时间，而且随着气温逐渐转冷，留给苗场生产秋苗的时间已经不多，秋苗产量难有大的起色。
亲鱼混杂 来年鱼苗质量存忧
我国罗非鱼苗生产历来以海南和广东两省为主，由于得天独厚的气候条件，海南基本全年都可不间断生产苗种，因此大量罗非鱼苗场聚集于此，是最主要的罗非鱼苗生产地，据不完全统计，仅在此次海南重灾区文昌一带就聚集了上百家大大小小的罗非鱼苗场。倘若苗场亲鱼因水灾大量逃走，按照亲鱼培育所需的时间推算，至少需要两年的时间，鱼苗生产才能完全恢复，无疑会对未来的种苗供求格局带来极大影响。
10月9日，本刊致电海南海南各大罗非鱼苗场了解情况时，海南新吉水产科技有限公司总经理何学军表示，由于大水尚未退去，苗场亲鱼损失的总体情况还不能确定。尽管亲鱼损失具体数目目前还难以确定，影响也未可获知，但不少业内人士私下告诉本刊，受水灾影响，海南明年的早春种苗生产肯定会因此而供应紧张。
根据本刊了解，广东许多苗场近日已经准备增加亲鱼数量并搭设温棚，及早生产以此抢占来年的早春苗市场。茂名市伟业罗非鱼良种场总经理简伟业表示，搭设温棚一来明年可以早点生产，另外也可以将鱼苗放在温棚暂养，等气温稳定后养殖户一旦有需求就可以马上供应，以此稳定早春种苗市场。
实际上，此次水灾对海南地区苗场的影响可能还不仅于此，在采访过程中，有不少业内人士对来年罗非鱼苗的质量表示了担心，'这次海南受灾的面积非常大，很多苗场的亲鱼塘和养殖塘都在一起，大水一淹，亲鱼和养殖的鱼就会混在一起，没有办法区分开来，这样配对后产出来的罗非鱼苗质量很难得到保证，明年罗非鱼苗的可能又将是鱼龙混杂的局面了'。