一、硫酸铜杀灭病原体的能力随着水体环境的变化而不同。一般来说，其毒性随着温度的升高而增强，随着PH值的增加、有机物的增多和食盐的存在而减小。因此用药量应根据水环境的具体情况而灵活掌握。
二、硫酸铜的安全浓度范围较小。一般使用时，浓度为0.5～0.7ppm的硫酸铜全池泼洒或用浓度为8ppm的硫酸铜浸浴20～30分钟。因此，使用时要准确测量养殖用水的体积，正确计算用药量。
三、硫酸铜过量会引起鱼类肾组织坏死、造血组织破坏、肝脂肪增加，同时还可能残留在鱼类的鳃、肌肉和肝内，妨碍肠道的吸收，从而影响鱼类的摄食和生长，故不能经常使用。
四、硫酸铜经常与硫酸亚铁按5∶2的比例混合使用。硫酸亚铁主要是消除固着物，为硫酸铜杀灭寄生虫扫除障碍。尤其是中华鱼蚤寄生虫病，因病鱼鳃丝末端肿胀发白，黏液大量增加。如果单用硫酸铜作用就不明显，而必须与硫酸亚铁混在一起用才可以，注意硫酸亚铁的使用浓度与硫酸铜相同。
五、溶解硫酸铜的水温不要超过60℃，否则药液容易失效。
六、硫酸铜对小瓜虫病无效。由于小瓜虫是在鱼体表面形成囊包，不易被硫酸铜杀灭，使用后还会引起鱼类大量死亡。