牦牛寄生虫病分布普遍，危害严重。各牦牛产区的调查表明，危害牦牛的寄生虫病主要有牦牛牛皮蝇蛆病、螨虫病、牦牛胃肠道线虫病、牦牛多头蚴病、牦牛肝片吸虫病、牦牛前后盘吸虫病、牦牛绦虫病、牦牛棘球蚴病、牦牛囊尾蚴病、牦牛肺线虫病、牦牛的外寄生虫病等。对牦牛寄生虫病的进行流行病学研究，发现牦牛体内冬季有一个显著的寄生虫幼虫寄生高潮，这个幼虫高潮是形成春季成虫高潮的主要来源，而春季的成虫高潮又与牦牛春乏死亡密切相关。因此，冬初是牦牛的寄生虫病时驱杀寄生阶段幼虫，对于早期预防春季寄生虫病高潮，控制因寄生虫病引起的春乏死亡具有重要作用。
驱虫的作用
秋末冬初进行牦牛驱虫，具有许多优点：秋末冬初，牦牛正是膘肥体壮，对药物的耐受性较强，正是进行驱虫的最佳时节；牦牛饲养在冬季牧场，相对集中，驱虫后牦牛的粪便便于收集处理；冬初有些地方牦牛进行补饲，驱虫药可以和补饲的精料一起，给药方便；控制来年的寄生虫幼虫寄生高潮，降低牦牛春乏死亡的发生。
药物选择
驱虫药选用，应选用广谱、安全、高效和便于使用的驱虫，剂型便于操作使用，尤其是便于牧民使用，特别是便于对在人少畜多条件艰苦的高寒牧区推行冬季驱虫措施至关重要。可选用的药物有一下几种：
丙硫咪唑：该药又名肠虫清, 是一种广谱高效低毒的常用驱虫药，对多属线虫及其寄生阶段幼虫和绦虫、双腔吸虫有效，应该优先选用，按照50 mg／kg剂量进行口服给药效果显著，为巩固驱虫效果，停药半月后后，可进行第2疗程治疗，一般2个疗程就可以达到很好的驱虫效果.
伊维菌素：该药对体内外寄生虫特别是线虫和节肢动物均有良好驱杀作用。但对绦虫、吸虫及原生动物无效，可驱杀牦牛的，按照0.2 mg/kg皮下注射或口服、0.5 mg/kg剂量背部浇泼，可驱杀牦牛的胃肠道线虫和牛皮蝇、体虱等寄生虫。
吡喹酮：该药为广谱抗吸虫和绦虫药物，适用于牦牛的吸虫和绦虫的驱杀，口服采用50mg/kg体重给药，可治疗牦牛包虫病。
给药方式
牦牛驱虫应采用口服给药方式为主，按照使用剂量与精料拌合给予，药物也可以包裹于糌粑中给予，大部分牧民没有响应的知识，皮下注注射和浇泼剂的使用有一定的困难，需要基层技术人员做好示范。药物可以单独也可以采用两种以上联合用药，以达到节省人力又能有效驱杀寄生虫的效果。
注意事项
药物剂量要按照使用说明严格控制，以免发生中毒；驱虫后的粪便要集中收集处理；对于家庭饲养的犬也要驱虫，切断犬与牦牛之间寄生虫的传播；对于患有其它疾病的牦牛暂缓驱虫；发生中毒的牦牛要及时救治，以免牦牛死亡。