鸭病防治常用的抗菌素有磺胺类药物和抗生素两大类。
磺胺类药物
磺胺（氨苯磺胺）-（SN） 为白色或微黄色结晶或粉末，难溶于水，多用于感染性外伤。
磺胺噻唑-（ST） 磺胺噻唑为白色或微黄色粉末，无味，难溶于水，易溶于碱性溶液，是磺胺药中抑菌作用较强的一种。在肠道中可被吸收，由肾脏排出。该药应用于链球菌、葡萄球菌感染的疾病。第一次应用时应加大剂量（倍量）以后每隔4小时喂一次，症状消失后，还要以维持量的一半继续喂1天~2天，以彻底治愈。每只鸭每日0.2克~0.5克，在服药时应配合等量的碳酸氢钠内服。
磺胺嘧啶-（SD） 磺胺嘧啶为白色或淡黄色粉末，无味，不溶于水，易溶于碱性溶液中，毒性小，被肌体吸收得慢，排泄快。作用与剂量同磺胺噻唑。
磺胺脒（磺胺胍、磺胺嗪）-（SG） 磺胺脒为白色粉状结晶，味微苦，难溶于水。其作用比磺胺噻唑弱，口服后只有部分被吸收，而大部分留在肠内。所以该药主要用于细菌性和球虫性肠炎。可以0.5%~0.6%的比例拌在饲料中喂给。
磺胺甲基嘧啶-（SM1）和磺胺二甲基嘧啶-（SM2） 这两种药与磺胺嘧啶类似，但吸收较快，排泄较慢，在体内可维持较高的浓度和和较长的时间。可治疗副伤寒、禽霍乱等病，用量为饮水量的0.025%~0.05%。
磺胺吡-（SPP） 磺胺吡唑为中效磺胺类药，抗菌作用较弱。优点是容易被吸收，副作用小。每12小时服一次。
注意：磺胺类药物不得用于产蛋鸭和种鸭，以免引起产蛋率下降。
抗生素
青霉素青霉素种类很多，常用的是青霉素G，临床主要用钠盐或钾盐。该药主要对革兰氏阳性菌有强大的抑菌作用。肌肉注射每只鸭2万单位~4万单位；幼雏每只用1000万单位~5000单位，中雏可用5000单位~10000单位。拌入饲料可防治球虫病。
链霉素常用其硫酸盐、盐酸盐。该药对结核杆菌和多数革兰氏阴性菌有效，对有些革兰氏阳性菌如丹毒杆菌也有效，对其他阳性菌则不如青霉素效力强。在体内的有效浓度一般可维持12小时，排泄速度比青霉素较慢。肌肉注射每只成鸭50毫克~100毫克，雏鸭每只10毫克~40毫克。饮水可用0.01%~0.02%。
四环素族土霉素、金霉素和四环素同属四环素族广谱抗菌素。口服剂量为每公斤体重第一次50毫克~100毫克，第二次减半。也可用0.02%拌入饲料中喂服。
氯霉素为广谱抗菌素，抑菌范围与四环素族相仿，但对革兰氏阳性菌的作用比金霉素、土霉素为强。内服剂量：每只鸭每日10毫克~20毫克，或5公斤饲料中加2.5克，也可在饮水中加入0.1%~0.2%。