本病潜伏期的长短随家禽所感染病毒的毒力、病毒数量、感染途径等不同有较大差异，由几小时至几天不等。其病型根据临床症状及病理变化不同可分为急性败血型、急性呼吸道型和非典型三类。
1.急性败血型禽流感(典型禽流感)
病禽主要的症状表现为高度沉郁、昏睡，张口喘气，流泪流涕(在水禽有时可见眼鼻流出脓样液体)，冠髯发绀、出血，头颈部肿大，急性死亡。部分病例出现共济失调、震颤、偏头、扭颈等神经症状。病理变化特征是眼角膜混浊，眼结膜出血、溃疡;翅膀、嗉囊部皮肤表面有红黑色斑块状出血等;还常见脚胫出血(脚胫鳞片出现红褐色出血斑块)、水肿;皮下水肿(尤其是头颈、胸部皮下)或呈冻胶样浸润;肺脏出血水肿，脾脏有灰白色斑点样坏死，胰脏有褐色斑点样出血、变性、坏死;法氏囊出血;从口腔至泄殖腔整个消化道黏膜出血、溃疡或有灰白色斑点、条纹样膜状物(坏死性伪膜)，其他组织器官亦可能有出血，并常可见有明显的纤维素性腹膜炎、气囊炎等。有的病鸡心肌有灰白色坏死性条纹。
2.急性呼吸道型禽流感(典型禽流感)
病禽主要表现为流泪流涕、呼吸急促、咳嗽、打喷嚏，鼻窦肿胀，下痢，部分发生死亡(在与新城疫病毒或其他禽I型副黏病毒株合并感染时，死亡率较高)。主要病理变化为喉头气管出血，鼻窦积聚分泌物，眼结膜水肿出血，有时亦见类似急性败血型禽流感的病理变化。
3.非典型禽流感
病禽一般表现为流泪、咳嗽、喘气、下痢，产蛋率大幅度下降(下降幅度为50%～80%)，并发生零星死亡。大体病理变化为鼻窦、气管、气囊、肠道有一些渗出性炎症，有时见气囊有纤维素性渗出，囊壁增厚，母禽发生卵黄性腹膜炎，输卵管时有炎症渗出物。