疫苗免疫后引起轻微呼吸道的原因主要有以下几个方面：
一、免疫反应
养殖户希望防止疫苗反应，因为疫苗反应对鸡的存活率和生产性能均有不利的影响。有害的疫苗反应对养殖户的经济效益有负面影响，特别是在冬季，肉鸡发生过度的疫苗反应现在是普遍的现象。鸡群过度的疫苗反应可以引发增重迟缓、饲料转化率降低、死淘率高、治疗成本增加。然而，疫苗反应是呼吸道活苗接种后发生的正常现象，是机体免疫系统产生应答的指征。就连灭活苗（油苗）接种也可在接种的部位产生局部炎症的疫苗反应现象，因为抗原（活苗）刺激免疫系统是鸡抵抗疾病所必需的，所以疫苗反应的缺乏表明免疫系统没有被激活。这可由几种因素引起：
1、达不到最低疫苗剂量。
2、活苗在接种前被灭活或在免疫时鸡本身就有足够的免疫力等。
二、有害的疫苗反应并不能达到免疫的目的，应该尽量避免。有几种因素能影响疫苗反应的严重程度：
1、鸡的质量。
2、母源抗体水平。
3、疫苗毒（菌）株和所接种的剂量。
4、免疫途径、接种时间、免疫抑制。
5、鸡舍通风和间隔时间、饮水和空气的质量。
肉鸡正常的呼吸道疫苗反应通常在接种后2-3天开始，并维持5天左右。因为1日龄免疫后所产生抗体的缓冲作用，在以后加强免疫后疫苗反应通常较轻。然而，在冬季的几个月中，当鸡舍密闭保温时，空气交换减少，空气质量下降，疫苗反应较重。鸡舍中灰尘和氨气的积累，导致呼吸道疫苗反应更加严重，而且在两次免疫之间不会完全消失。造成首免后到出栏时呼噜声都没有停止过。呼吸道疫苗反应通常以甩鼻、啰音和头部振颤为特征。
疫苗的滚动反应是与常规相比持续时间和/或强度增加的反应。如果被免疫的鸡状态很差，（如脱水、脐部愈合不良或接触大量的曲霉菌孢子等）接种呼吸道疫苗可以激发滚动反应,在孵化后最初几小时吸入的细菌、霉菌或卵黄中存在的细菌和真菌能使免疫复杂化。