(1)弱毒冻干疫苗为低毒力的活的病原微生物，而灭活疫苗是无毒力的死的病原微生物。
(2)弱毒疫苗接种后，其病原微生物要在体内复制、增殖进而刺激机体产生抗体，灭活疫苗不需也无法在体内复制、增殖。
(3)弱毒活疫苗既可刺激机体的细胞免疫，又可以刺激机体产生体液免疫;灭活疫苗刺激机体产生细胞免疫的能力较差。
(4)弱毒活疫苗刺激机体产生抗体速度快，维持时间短。灭活疫苗刺激机体产生的抗体慢，维持时间长。
(5)弱毒活疫苗一般采用真空冻干工艺，灭活疫苗不需要真空保存，但所使用的佐剂对疫苗免疫效果影响较大。
(6)弱毒疫苗通常需要冷冻保存，灭活疫苗(油佐剂疫苗)一般为冷藏保存。
(7)弱毒疫苗可采用点眼、滴鼻、口投、饮水、注射等多种接种方式，油佐剂灭活疫苗一般只能通过注射免疫。