呼吸系统疾病可分为病毒性呼吸道、细菌性呼吸道、寄生虫性呼吸道、营养代谢性呼吸道、中毒性呼吸道、支原体和衣原体等。正因为呼吸道疾病的复杂性所以在临床上区分是比较困难的。常见的病毒呼吸道有以下几种：
一、传染性支气管炎：
该病多发于雏鸡和青年鸡，成年蛋鸡感染一般不会造成死亡现象，只会对产蛋率及蛋的质量造成一定的影响。鸡的日龄越小发病率和死亡率就越高。临床表现为甩鼻、咳嗽、呼噜、且以咳嗽为重，并张口喘气，有咯咯的叫声，排黄白色稀便，精神沉郁，死亡鸡只多是比较健壮的且死亡时多腹部朝上，鸡冠颜色发紫，产蛋鸡群表现为产蛋率下降、蛋壳颜色发白、畸形蛋增多，且蛋清质量稀薄如水。病理剖检见气管有黄白色痰液，尤其是在支气管和末级支气管有黄白色栓塞物（注意末级支气管的病变，好多兽医都不注意末级支气管的病变，往往贻误病情，造成误诊）。每年的3-5月份是肾传支的发生率较高，且死亡率较难控制
二、温和型流感引起的呼吸道：
该病多发生于成年鸡，但如果种鸡感染该病的话，孵化出的雏鸡感染率也非常高，且死亡率较高控制较困难。临床表现为呼噜、咳嗽、并伴随着怪叫声，且声音比较凄惨，病鸡精神沉郁，排黄白绿色稀便，鸡群有时会出不同程度的肿头现象，死淘率明显偏高高。病理变化表现为淋巴滤泡肿胀出血（但出血较新城疫差，流感不会出现淋巴滤泡溃疡的情况）腺胃乳头肿胀出血，胰腺出血，心外膜心内膜出血明显，胸腺肿胀出血。卵泡液化程菜花样
三、新城疫引起的呼吸道：
该病的发生不分任何季节和日龄，但以成年鸡多发且死亡率偏高，近些年来感染日龄有不断年轻化的趋势。临床表现为呼噜、甩鼻、咳嗽、但张口呼吸的比重较小，个别出现神经症状，发病鸡排黄绿色稀便，嗉囊积液，精神状况欠佳。病理变化表现为淋巴滤泡肿胀出血，腺胃乳头肿胀出血，肌胃角质膜下出血，胸腺肿胀出血，气管粘膜潮红，卵泡充血、出血
四、传染性喉气管炎：
传染性喉气管炎是蛋鸡常见的呼吸道疾病之一。该病多发生于青年鸡和成年蛋鸡，发病时多表现为突然零星死亡，咳嗽、呼噜、张口呼吸并且不断有痰液和血液从口中咳出，病死鸡鸡冠苍白。病理变化主要表现为气管内含大量的痰液或血样栓塞物，气管粘膜粗糙。