鸡大肠杆菌的危害近几年来有逐渐扩大的趋势，不少鸡场由于大肠杆菌造成的死鸡数往往占死亡数的50％以上。我们要想提高鸡群的成活率和产蛋率，提高养殖水平，必须下大功夫把鸡大肠杆菌病控制好。
然而，控制好鸡大肠杆菌病是十分困难的事，必须贯彻综合防制的原则，特别是要做好种蛋和孵化过程中的消毒以及注重饲料和饮水的卫生，加强环境的消毒等。药物防治有一定作用，要根据药敏试验选用敏感药物。但药物防治容易产生抗药性，长期大量用抗菌素危害人的健康，因此靠药物来防治鸡大肠杆菌病不值得提倡。由于致病性鸡大肠杆菌类型复杂，对某一个场来说，菌型还是常发生变化，用大肠杆菌制灭活苗需一定技术条件，因此，用菌苗来防治鸡大肠杆菌病受到一定限制。
控制鸡大肠杆菌病的发生最好的方法是用微生态制剂，好的微生态制剂不仅能很好地保护肠道不受致病性大肠杆菌和沙门氏菌的侵害，还能促进消化，提高鸡体的免疫力，还没有药残，长期使用微生态制剂可以大大改善场区和鸡舍的环境，减少种蛋被有害菌污染的机会，提高种蛋的合格率、孵化率和健雏率。