掩埋消毒法 选择地势高燥、地下水位较低的地块，挖一个深坑，坑的深度应在2米以上，大小视粪便的多少而定，要使掩埋后的粪便表面距地表50厘米为宜。消毒剂可选用漂白粉或新鲜生石灰。可采用混合消毒的办法，将消毒剂与受污染的粪便充分混合，倒入坑内；也可先在坑内撒入一层消毒剂，然后将受污染的粪便倒入，每倒入4～5厘米的粪便，撒一层消毒剂，粪便顶部再撒一层消毒剂，然后覆土掩埋，顶部堆成土堆儿。5～6个月后，这些粪便即可挖出充当肥料。 生物消毒法 在远离居住点和水源的地方，挖筑圆形或方形的消毒池，消毒池深度、宽度均为3米，长度视实际需要而定，池口最好盖上水泥盖板，只留一个倒粪口。将每天清除的粪便、垫草倒入池内，直至池满为止。堆积发酵13个月后，即可挖出作肥料使用。 如果粪便比较干燥，可使用浅沟法进行生物发酵。在地面挖一浅沟，深约20厘米，宽1.5～2米，长度不限，随粪便量确定，先在沟内堆放25厘米厚的非传染性粪便或作物秸秆，再堆放欲消毒的粪便，高1～1.5米，然后在粪堆外面铺上10厘米厚的非传染性粪便或谷草，覆盖10厘米厚的沙土，3～5个月后，即可挖出肥田。 焚烧消毒法 在发生气肿疽、梭菌感染等传染病时，要采用焚烧法进行严格消毒处理。 规模化养殖场要建设符合要求的粪污处理设施，如漏缝地板，将粪便干稀分离，稀薄部分进发酵池，干燥部分混合污染的饲料和其他污物，混入柴草后进行焚烧。