使用药物治疗药注意预防混合感染，一般容易与附红体混感的病如圆环病毒病、喘气病、传染性胸膜肺炎等。
目前国内主要采用土霉素、四环素、强力霉素来治疗猪附红细胞体病。
土霉素，广谱抗菌药，除杀细菌外，对衣原体、支原体、各种立克次氏体、螺旋体、放线菌和某些原虫还有抑制作用。临床上常采用注射法和口服给药，不良反应为在注射局部发炎、坏死和消化道紊乱。静注给药时，速度一定要慢，并观察家畜反应，发现异常应立即停药。兽医临床中常用长效土霉素注射液，按药物说明书使用，每天肌注10毫升/次，连续2～3天，或每周注射1次，连续注射4～5次。
也可在发病初期用土霉素、四环素，剂量按15毫克/公斤体重，分两次肌肉注射，可连续使用一周。或按强力霉素300～400ppm拌料或150～200ppm饮水，连续使用，直至症状消失。或在确认虫体感染后用0.1%～0.2%土霉素拌料，连续投喂10天，停喂7天，然后根据症状决定是否进行第二疗程。对于确诊阳性感染的母猪族群来讲，离乳10天后的小猪可于水中添加水溶性的土霉素来治疗，对于群体的病猪可于每吨饲料中添加150克的土霉素来做治疗。
强力霉素也是四环素类广谱抗生素，为长效、广谱、高效、半合成四环素族新抗菌素，作用与盐酸四环素相同，但抗菌作用较四环素强，排泄缓慢，维持血浓度时间长，给药后药物分布于全身各组织和体液中，易于渗透于胸腔和乳汁，也易于通过胎盘进入胎儿血液循环，该药是治疗母猪附红细胞体病的首选药物。