一、静水孵化
把粘有受精卵的鱼巢放入水质清新的孵化池、孵化网箱或产卵池内孵化。每升水可放受精卵400～600个。泥鳅受精卵静水孵化时要注意防止受精卵挤压在一块，不然会因缺氧而影响孵化率。受精卵相互挤压时，要用搅水的方法或用吸管使之分离开来。
二、流水孵化
流水孵化用流水或微流水孵化，是把受精卵放在孵化缸、孵化箱或孵化环道中进行孵化。泥鳅受精卵流水孵化有以下两种方法：①附巢流水孵化：将附在鱼巢上的受精卵放入孵化设施中进行微流水孵化，其水流速度以不冲落附在巢上的卵为宜，放养密度为800～1200粒卵/升水。 ②去巢流水孵化：掌握好流速，将脱黏或不脱黏的泥鳅受精卵放入孵化设施中孵化，孵化环道、孵化缸等流水孵化每升水中放卵粒800～1200粒。