与单纯使用活力99做发酵床的最大的区别就是对大肠杆菌的抑制效果更好了，活力发酵床复合菌由于是专门针对发酵床使用的，所以，里面增加了很多的偏好氧发酵的菌种，例如枯草芽孢杆菌、侧孢芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌等，而这些菌在活力99生酵剂中是比较少的，这是为什么呢，这是因为活力99生酵剂之前主要是用来发酵糟渣和制作保健液等的，而这些发酵都是厌氧发酵过程，所以，相对来说，这些菌的加入量就少一些，但现在开发的活力发酵床复合菌，由于是专门用于发酵床的，所以，设计起来就比较放开手脚来设计，这些菌的使用量也更多起来了。
这些芽孢杆菌，以及粪便中常见的乳酸菌如屎肠球菌都有在新产品中，这些菌与大肠杆菌的生长繁殖条件相似，既然是与病原菌相似的生长繁殖条件，显然就会存在竞争性抑制大肠杆菌的效果，当然还有其他机理来抑制大肠杆菌，对发酵床产氨味，产硫化氢就具有更好的抑制效果了，分解粪便当然也更好一些。
当然，今后您可以只用活力发酵床复合菌来制作和维护发酵床，例如刚开始制作时，每20平方米用400克，也就是一包，平时正常维护时每平米一克就可以了，其他管理按网站上技术规范来操作就可以了。
首先可以肯定的是，直接添加到发酵床垫料上的粉剂，建议使用活力发酵床复合菌，而不用活力99生酵剂了，因为活力发酵床复合菌是专门针对发酵床而设计的菌种组合，含有数量更多的枯草芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌、短小芽孢杆菌等分解粪便的优势菌群，对分解粪便的针对性强不仅效果更好，而且使用成本也更加低廉，针对性强等。
而活力99生酵剂在设计上由于要照顾到发酵糟渣的需要，所以，相应地使用成本就高了很大；
3.1 那么用活力99生酵剂制作的保健液也是一种活力强的微生物添加剂，它与活力发酵床复合菌在发酵床应用中如何区别使用
首先结论是两者配合使用是最好的，具体的配合方法在活力99生酵剂一章中已有谈到这个问题，请仔细阅读，具体原理见下述：
是的，保健液是一种优良的发酵床垫料用微生物液体，制作成本低，活力强，可以作为发酵床垫料中的菌种来源之一，但它的针对性仍然没有活力发酵床复合菌的针对性强；
保健液的优点是： ① 成本低，每公斤只要不到0.4元；② 活力强，因为是液体的，是细胞体状态，不是休眠体，所以，及时性好，可以在应紧时使用；③ 含有大量乳酸等有机酸，而乳酸等对粪便中的有害细菌如大肠杆菌有较强的杀灭作用，对益生菌的抑制作用却不强，所以，这也是保健液的优势之一；④ 保健液中还含有微生物所需要的大量生长因子，如B族维生素、氨基酸、小肽、低糖、未知因子等，可以为垫料中的微生物提供生长因子等营养；
活力发酵床复合菌的优势是：① 含有保健液中比较缺乏的枯草芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌、短小芽孢杆菌等分解粪便的优势菌群，对分解粪便的针对性强，适应分解粪尿的高渗高盐环境，和粪便的ph环境；② 转化氨氮能力强，非常适应分解粪便的需要；③ 对垫料的附植能力强，可有效地利用垫料作为载体形成微生态小环境；同时，新产品对大肠杆菌的抑制能力明显高于保健液，因为这些芽孢杆菌与大肠杆菌的生长繁殖条件是相似的，相似就会产生极强的竞争性抑制，如争夺附着点，争夺有限的营养成分等，以及枯草和地衣芽孢杆菌还会分泌杆菌肽和枯草菌素等生物抗生素，抑制有害细菌。
所以，两者配合使用的效果最好，特别是垫料感觉有点臭味，或分解能力有所下降时，两者配合最好，两者合作配合使用的方法见上述，主要是用在维护阶段。
如果两者要配合使用，配合的方法可以是：每20平方米发酵床，使用保健液2-3公斤，再使用活力发酵床复合菌20克（相当于每平方米一克）；这是平时 维护使用的量。有紧急情况时，如遇到有氨味产生，粪便分解不好时，可以适当加倍。
初次建设发酵床时，还是使用活力发酵床复合菌为宜，维护时可以考虑使用保健液与活力发酵床复合菌搭配组合使用，同时建议在发酵床上饲养的动物饲料中添加活力重菌泰产品，使其排泄的粪便中含有大量的有益细菌，里应外合进行粪便的分解，效果更为强大。