(一)仔牛的免疫程序
1日龄：牛瘟弱毒苗超免，仔牛生后在未采食初乳前，先注射一头份牛瘟弱毒苗，隔1～2小时后再让仔牛吃初乳，这适用于常发牛瘟的牛场。
7～15日龄：气喘病苗。
10日龄：传染性萎缩性鼻炎疫苗，肌注或皮下注射。
10～15日龄：仔牛水肿苗。
20日龄：肌注牛瘟苗。
25～30日龄：肌注伪狂犬病弱毒苗。
30日龄：肌注传染性萎缩性鼻炎疫苗。
35～40日龄:仔牛副伤寒菌苗，口服或肌注（在疫区，首免后，隔3～4周再二免）。 60日龄：牛瘟、肺疫、丹毒三联苗，2倍量肌注。
(二)后备公、母牛的免疫程序
1.配种前1个月肌注细小病毒疫苗。
2.配种前20～30天注射牛瘟、牛丹毒二联苗（或加牛肺疫的三联苗），4倍量肌注。
3.每年春天（3～4月份），肌注乙型脑炎疫苗1次。 4.配种前1个月接种1次伪狂犬疫苗。
(三)经产母牛免疫程序
1.空怀期：注射牛瘟、牛丹毒二联苗（或加牛肺疫的三联苗），4 倍量肌注。
2.每年肌注一次细小病毒灭活苗，3年后可不注。
3.每年春天3～4月份肌注1次乙脑苗，3年后可不注。
4.产前2周肌注气喘病灭活苗。
5.产前45天、15天，分别注射K88、K99、987P大肠杆菌苗。
6.产前45天，肌注传染性胃肠炎、流行性腹泻二联苗。
7.产前35天，皮下注射传染性萎缩性鼻炎灭活苗。
8.产前30天，肌注仔牛红痢疫苗。
9.产前25天，肌注传染性胃肠炎、流行性腹泻二联苗。
10.产前13天，肌注牛伪狂犬病灭活苗。
(四)配种公牛免疫程序
1.在做好仔牛阶段免疫后，每年春、秋各注射一次牛瘟、牛丹毒二联苗（或 加牛肺疫的三联苗）4倍量肌注。
2.每年3～4月份肌注乙脑苗1次，3年后可不注。
3.每年肌注气喘病灭活苗2次。
4.春、秋各肌注1次牛伪狂犬病疫苗。
5.每年肌注两次牛繁殖与呼吸综合症疫苗。
(五)其他疾病的防疫
1.口蹄疫:常发区：常规灭活苗，首免35日龄，二免90日龄，以后每3个月免疫1次；高效灭活苗，首免35日龄，二免180日龄，以后每6个月免疫1次。非常发区：常规灭活苗，每年9、12月份和次年1月份免疫1 次；高效灭活苗，每年9月份和次年1月份各免疫1次。
2.牛传染性胸膜肺炎:仔牛1、3、5周各免1次。
3.牛链球菌病:成年母牛每年春秋各1次，仔牛10日龄首免，60日龄2免，或出生后24小时首免，断奶后2周2免。