收获后的牧草种子必须尽快进行加工，否则由于草种湿度较大堆积起来容易发霉变质，导致种子失去生命力。同时只有加工后的种子才具备贮存条件，也只有通过加工后的种子才能成为商品。
烘干是牧草种子加工中的一个重要工序，烘干后的草籽不仅便于加工，而且加工后能长
期保存。一般田间收获的草籽湿度在18％以上，有的高达30％以上，加工前必须把湿度降低到12％～13％。目前普遍采用40℃～45℃热空气烘干，平均每小时可降低湿度2％。热空气烘干的形式有多种，有的采用装箱成行布置或平面布置底部通风；有的采用装箱立体布置底部通风；也有的采用连续烘干装置。目前的加热装置大部分以油或煤为燃料来加热空气，也有的用精选草籽时选出来的废料作燃料，烘干后的草籽要进行湿度检查，湿度符合要求才能进入初选机。
初选机用来清除草籽中的较大杂质，如破碎的叶子和茎秆等。初选机全部采用筛选，有的初选机在进料装置后部设一长度1米左右逐蒿器，用来清除茎秆。经过初选机处理的种子进入除芒机或刷种机。
除芒机、刷种机的功能主要是除芒和刷邑毛，并把粘合在一起的草籽分开，同时清除草
籽上粘污的泥土、灰尘。
第一次清选是对草籽进行精加工的第一步。第一次清选由筛选和风选两部分组成，筛选是根据种子厚度或宽度进行精选。一般为两层筛，第一层筛允许草籽和小于草籽的物料通过，大于草籽的物料被清除；第二层筛只允许大于草籽的物料通过，小于草籽的物料被清除。被保留下来的草籽再被风选，风选是根据筛出物料的不同漂浮性能将不成熟的草籽及虫蛀的草籽从好草籽中分离出来。第一次清选后的种子进入二次清选。
第二次清选是根据种子的长度进行清选，使用的设备是窝眼滚筒清选分级机。窝眼的几何尺寸是按草籽的长度设计的，清选不同草籽时选用具有不同窝眼的滚筒。一般情况下用一组两个窝眼滚筒来完成精选，第一个滚筒清除长度大于草籽的物料，第二个滚筒清除小于草籽的物料。
对于要求较高或难以清选的草籽，通过上述工序之后如仍达不到要求，还要增加一些特殊清选工序，最常用的是重力清选机。它是利用物料颗粒之间的重量差进行分离的。草籽放在带有细孔的筛面上，从筛面下部向上吹风使草籽处于漂浮状态，筛面是倾斜的，工作时它作横向振动，在振动中草籽被分成不同等级，以达到最终清选的目的。重力清选对清除沙粒，清除尺寸和形状与正常草籽非常接近的杂草种子是很有效的。
通过清选后的草籽需要拌药或包衣，拌药和包衣是增产增收的重要措施，拌药、包衣一般在拌药机或包衣机上进行。拌药、包衣的作用有三个：①防止真菌生长，便于长期保存或长途运输中不变质；②防止种子播种到田间后受病虫害的侵袭；③添加一些促进发芽和生长的药物，促进作物生长。
对一些小粒种子以及一些不规则的种子，为便于播种要进行丸粒化。丸粒化的目的除具有拌药、包衣的三个作用外，在种子外面包裹一层增重剂使之达到增重增体的目的，为机播和飞播的可靠作业创造条件。
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