天然轮虫大多数生活在水洼、池塘等处，特别是在那些池水平静、肥沃的地方，例如水产冷库周围的坑塘、渔获物晒场周围的水沟、池塘，种类较多，通常有褶皱臂尾轮虫、萼花臂尾轮虫和晶囊轮虫等。
春季当水温达15℃以上时，选择无风、晴朗的天气，待天然轮虫上浮于池塘表层，用150-200目的筛绢做成的浮游生物网在池塘里来回拖捕，将捕捞的轮虫带少量的水倒人塑料桶内。对那些天然轮虫群体聚集呈棕红色或褐红色的水体可直接用塑料桶舀取。由于天然轮虫生活在水质肥沃的水域内；水中含有许多污染物质和致病细菌，必须经过多次淘洗后方可使用。首先将捞回的天然轮虫用40目的筛绢过滤，滤去杂草、大型泥砂等，再用80目的筛绢滤去较小的泥砂，最后将过滤后的天然轮虫放在200目筛绢网里，使用干净水经多次淘洗，直至滤出的水和干净水色相同(即无污浊水、黑色水流出)时即可投喂。
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